我有动力使用熊猫滚动功能来执行滚动多因素回归(这个问题不是关于滚动多因素回归).我希望我能够在df.rolling(2)之后使用apply并获取生成的pd.DataFrame,用.values提取ndarray并执行必要的矩阵
这是我发现的:
import pandas as pd import numpy as np np.random.seed([3,1415]) df = pd.DataFrame(np.random.rand(5, 2).round(2), columns=['A', 'B']) X = np.random.rand(2, 1).round(2)
对象是什么样的:
print "\ndf = \n", df print "\nX = \n", X print "\ndf.shape =", df.shape, ", X.shape =", X.shape df = A B 0 0.44 0.41 1 0.46 0.47 2 0.46 0.02 3 0.85 0.82 4 0.78 0.76 X = [[ 0.93] [ 0.83]] df.shape = (5, 2) , X.shape = (2L, 1L)
矩阵乘法表现正常:
df.values.dot(X) array([[ 0.7495], [ 0.8179], [ 0.4444], [ 1.4711], [ 1.3562]])
使用apply逐行执行点产品的行为符合预期:
df.apply(lambda x: x.values.dot(X)[0], axis=1) 0 0.7495 1 0.8179 2 0.4444 3 1.4711 4 1.3562 dtype: float64
Groupby – >应用表现如我所料:
df.groupby(level=0).apply(lambda x: x.values.dot(X)[0, 0]) 0 0.7495 1 0.8179 2 0.4444 3 1.4711 4 1.3562 dtype: float64
但是当我跑步时:
df.rolling(1).apply(lambda x: x.values.dot(X))
我明白了:
AttributeError: ‘numpy.ndarray’ object has no attribute ‘values’
好的,所以pandas在其滚动实现中使用了直接的ndarray.我能解决这个问题.不要使用.values来获取ndarray,让我们尝试:
df.rolling(1).apply(lambda x: x.dot(X))
shapes (1,) and (2,1) not aligned: 1 (dim 0) != 2 (dim 0)
等待!什么?!
所以我创建了一个自定义函数来查看正在进行的操作.
def print_type_sum(x): print type(x), x.shape return x.sum()
然后跑了:
print df.rolling(1).apply(print_type_sum) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) <type 'numpy.ndarray'> (1L,) A B 0 0.44 0.41 1 0.46 0.47 2 0.46 0.02 3 0.85 0.82 4 0.78 0.76
我生成的pd.DataFrame是一样的,这很好.但它打印出10个单维ndarray对象.滚动怎么样(2)
print df.rolling(2).apply(print_type_sum) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) <type 'numpy.ndarray'> (2L,) A B 0 NaN NaN 1 0.90 0.88 2 0.92 0.49 3 1.31 0.84 4 1.63 1.58
同样的事情,期待输出,但它打印了8个ndarray对象.滚动为每列产生一个长度窗口的单维ndarray,而不是我预期的形状ndarray(window,len(df.columns)).
问题是为什么?
我现在没有办法轻松运行滚动多因素回归.
使用strides views concept on dataframe
,这是一个矢量化的方法 –
get_sliding_window(df, 2).dot(X) # window size = 2
运行时测试 –
In [101]: df = pd.DataFrame(np.random.rand(5, 2).round(2), columns=['A', 'B']) In [102]: X = np.array([2, 3]) In [103]: rolled_df = roll(df, 2) In [104]: %timeit rolled_df.apply(lambda df: pd.Series(df.values.dot(X))) 100 loops, best of 3: 5.51 ms per loop In [105]: %timeit get_sliding_window(df, 2).dot(X) 10000 loops, best of 3: 43.7 µs per loop
验证结果 –
In [106]: rolled_df.apply(lambda df: pd.Series(df.values.dot(X))) Out[106]: 0 1 1 2.70 4.09 2 4.09 2.52 3 2.52 1.78 4 1.78 3.50 In [107]: get_sliding_window(df, 2).dot(X) Out[107]: array([[ 2.7 , 4.09], [ 4.09, 2.52], [ 2.52, 1.78], [ 1.78, 3.5 ]])
那里有巨大的改进,我希望在更大的阵列上保持显着!