我在R中有一个大数据框,我想基于现有列创建一些新列.但是,对于每一行,新值还取决于其他一些行. 这是一些虚拟数据 colnames - c('date', 'docnr', 'clientid', 'values')docnr - c(1,2,3,4,5,6)dates - c('2
这是一些虚拟数据
colnames <- c('date', 'docnr', 'clientid', 'values') docnr <- c(1,2,3,4,5,6) dates <- c('2017-01-01', '2017-02-01', '2017-03-01', '2017-04-01','2017-01-05', '2017-02-05') clients <- c(1,1,1,1,2,2) values <- c(10,14,4,7,9,19) df <- data.frame(cbind(dates, docnr, clients, values)) names(df) <- colnames df$date <- as.Date(df$date, format = "%Y-%m-%d") df date docnr clientid values 1 2017-01-01 1 1 10 2 2017-02-01 2 1 14 3 2017-03-01 3 1 4 4 2017-04-01 4 1 7 5 2017-01-05 5 2 9 6 2017-02-05 6 2 19
我想要做的是,每一行(由docnr唯一标识)获取日期和客户端ID,并找到具有相同clientid和更早日期的所有其他行.
然后,我想从这个子集中计算一些东西.例如,我想要该子集中的总行数以及该子集的所有值的总和.
所以对于这个示例数据,我希望:
date docnr clientid values counts totals 1 2017-01-01 1 1 10 0 0 2 2017-02-01 2 1 14 1 10 3 2017-03-01 3 1 4 2 24 4 2017-04-01 4 1 7 3 28 5 2017-01-05 5 2 9 0 0 6 2017-02-05 6 2 19 1 9
目前,我使用for循环:
counts <- numeric(0) totals <- numeric(0) for (i in 1:nrow(df)) { tmp <- df[df$date< df$date[i] & df$clientid== df$clientid[i], c( "date", "docnr","value")] cnt <- nrow(tmp) tot <- sum(tmp$value) counts[i] <- res totals[i] <- tot } df$counts <- counts df$totals <- totals
对于700k行的数据帧(尚未完成运行),这个循环显然非常慢.使用doSNOW的并行实现似乎没有更好的扩展.
我尝试过使用sqldf的sql查询,但子查询一次只能返回1个值,这意味着我想要定义的每个新列都运行查询(我想稍后再添加更多的派生列) .
我遇到了一个带有SQL对象的解决方案(Is it possible to get multiple values from a subquery?),但是对象在R的sqldf中不起作用.使用联接不起作用,因为第二个查询需要包含来自第一个查询的信息.
我刚开始使用R(并且我对sql也不是很熟悉),所以如果有人知道更有效的方法,我会非常感激.
这里有两行基本R代码,使用ave进行分组.# get counts df$counts <- ave(df$docnr, df$clientid, FUN=seq_along) - 1L # get lagged cumulative sum df$totals <- ave(df$values, df$clientid, FUN=function(x) c(0, head(cumsum(x), -1)))
这回来了
df date docnr clientid values counts totals 1 2017-01-01 1 1 10 0 0 2 2017-02-01 2 1 14 1 10 3 2017-03-01 3 1 4 2 24 4 2017-04-01 4 1 7 3 28 5 2017-01-05 5 2 9 0 0 6 2017-02-05 6 2 19 1 9
我怀疑上面的代码会对你描述的数据执行得足够快.但是,data.table是一个推荐的包,用于处理可能有数十亿行的数据.与data.table中的上述代码类似
library(data.table) setDT(df)[, c("counts", "totals") := .(seq_len(.N) - 1L, shift(cumsum(values), fill=0)), by=clientid]
其中seq_len(.N)填充seq_along的角色,shift在前面的代码中填充c(0,head(cumsum(x), – 1))的角色.
这将返回一个data.table,其值与上面相同.
df date docnr clientid values counts totals 1: 2017-01-01 1 1 10 0 0 2: 2017-02-01 2 1 14 1 10 3: 2017-03-01 3 1 4 2 24 4: 2017-04-01 4 1 7 3 28 5: 2017-01-05 5 2 9 0 0 6: 2017-02-05 6 2 19 1 9
数据
df <- structure(list(date = structure(c(17167, 17198, 17226, 17257, 17171, 17202), class = "Date"), docnr = c(1, 2, 3, 4, 5, 6), clientid = c(1, 1, 1, 1, 2, 2), values = c(10, 14, 4, 7, 9, 19)), .Names = c("date", "docnr", "clientid", "values" ), row.names = c(NA, -6L), class = "data.frame")