caffe 以及caffe2 安装时portobuf库相关的编译问题

安装caffe出现protobuf版本问题，是由于anaconda安装了不同的protobuf版本

pip show protoc
protoc --version

sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler
sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
sudo apt-get install python-protobuf

出现icu相关的问题，重新编译安装

http://www.linuxfromscratch.o...

protobuf自己编译时出现a local symbol' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC错误

问题原因

　是用了protobuf默认的安装方式(以下代码)，如此生成的静态库libprotobuf.a不是PIC object，所以不能被其它库使用（64位的so必须使用-fPIC编译选项，所以要求所链接的静态库也必须是-fPIC编译)。

./autogen.sh
./configure --prefix=INSTALL_PTAH    
./make
./make install

解决方法

confiure步骤时加上两个变量参数：

./configure CFLAGS="-fPIC" CXXFLAGS="-fPIC --prefix=INSTALL_PATH

注意重新配置后需要make clean 清除一下原有的生成文件才有用

　编译caffe2出现from google.protobuf import symbol_database as _symbol_database错误

问题原因

编译的protobuf没有安装到python环境中

解决方法

按照上述方法下再protobuf3.5.0版本后重新安装

cd PROTOBUF_PATH/python
python setup.py build 
sudo python setup.py isntall

编译caffe2出现以下问题

../lib/libgtest.a(gtest-all.cc.o)：在函数‘testing::internal::FormatDeathTestOutput(std::string const&)’中：
gtest-all.cc:(.text+0xca9)：对‘std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...)’未定义的引用
gtest-all.cc:(.text+0xce3)：对‘std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...)’未定义的引用
../lib/libgtest.a(gtest-all.cc.o)：在函数‘testing::TestResult::GetTestPartResult(int) const’中：
gtest-all.cc:(.text+0x1faf)：对‘std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...)’未定义的引用
../lib/libgtest.a(gtest-all.cc.o)：在函数‘testing::TestResult::GetTestProperty(int) const’中：
gtest-all.cc:(.text+0x230f)：对‘std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...)’未定义的引用
../lib/libgtest.a(gtest-all.cc.o)：在函数‘testing::internal::UnitTestImpl::ConfigureStreamingOutput()’中：
gtest-all.cc:(.text+0x1bffe)：对‘std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...)’未定义的引用
../lib/libgtest.a(gtest-all.cc.o):gtest-all.cc:(.text+0x1d2d7): 跟着更多未定义的参考到 std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...)
../lib/libcaffe2.so：对‘std::thread::_M_start_thread(std::shared_ptr<std::thread::_Impl_base>, void (*)())’未定义的引用
../lib/libcaffe2.so：对‘__cxa_throw_bad_array_new_length’未定义的引用

问题原因

ubuntu14.0默认的gcc g++版本是4.8 需要升级到4.9

sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test
sudo apt-get update
sudo apt-get install gcc-4.9 g++-4.9

为Cmake 指定gcc g++版本

方法1：修改环境变量

修改环境变量，但是但是不一定都有用
export CC=/usr/local/bin/gcc-4.9
export CXX=/usr/local/bin/g++-4.9

方法2： 命令行设置cmake参数

cmake -D CMAKE_C_COMPILER=/usr/local/bin/gcc-4.9 -D CMAKE_CXX_COMPILER=/usr/local/bin/g++-4.9 ..

方法3:在CMakeList中设置变量

set(CMAKE_C_COMPILER "/usr/local/bin/gcc-4.9")
set(CMAKE_CXX_COMPILER "/usr/local/bin/g++-4.9")

判断caffe2是否安装成功，正常情况打印Success

cd ~ && python -c 'from caffe2.python import core' 2>/dev/null && echo "Success" || echo "Failure"

判断GPU是否正常，正常情况打印值为1

python2 -c 'from caffe2.python import workspace; print(workspace.NumCudaDevices())'

自编译protobuf>=3.2.0

# CAFFE2=/path/to/caffe2
cd $CAFFE2/third_party/protobuf/cmake
mkdir -p build && cd build
cmake .. \
  -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/c2_tp_protobuf \
  -Dprotobuf_BUILD_TESTS=OFF \
  -DCMAKE_CXX_FLAGS="-fPIC"
make install

编译caffe2时调用

cmake .. \
  # insert your Caffe2 CMake flags here
  -DPROTOBUF_PROTOC_EXECUTABLE=$HOME/c2_tp_protobuf/bin/protoc \
  -DPROTOBUF_INCLUDE_DIR=$HOME/c2_tp_protobuf/include \
  -DPROTOBUF_LIBRARY=$HOME/c2_tp_protobuf/lib64/libprotobuf.a

安装mxnet时出现libgfortran.so.1找不到的问题

ImportError: libgfortran.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

解决方法

conda install libgfortran=1

conda 可以指定安装版本