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如何获取自举的p值和自举的t值以及函数boot()如何工作?

来源:互联网 收集:自由互联 发布时间:2021-06-12
我想得到自举的t值和lm的自举p值. 我有以下代码(基本上是从一篇论文中复制而来). # First of all you need the following packagesinstall.packages("car") install.packages("MASS")install.packages("boot")library("car"
我想得到自举的t值和lm的自举p值.
我有以下代码(基本上是从一篇论文中复制而来).

# First of all you need the following packages
install.packages("car") 
install.packages("MASS")
install.packages("boot")
library("car")
library("MASS")
library("boot")

boot.function <- function(data, indices){
data <- data[indices,]
mod <- lm(prestige ~ income + education, data=data) # the liear model

# the first element of the following vector contains the t-value
# and the second element is the p-value
c(summary(mod)[["coefficients"]][2,3], summary(mod)[["coefficients"]][2,4])     
}

现在,我计算了bootstrapping模型,它给出了以下内容:

duncan.boot <- boot(Duncan, boot.function, 1999)
duncan.boot

ORDINARY NONPARAMETRIC BOOTSTRAP


Call:
boot(data = Duncan, statistic = boot.function, R = 1999)


Bootstrap Statistics :
        original      bias    std. error
t1* 5.003310e+00 0.288746545  1.71684664
t2* 1.053184e-05 0.002701685  0.01642399

我有两个问题:

>我的理解是bootrapped值是原始加上偏差,这意味着两个自举值(自举t值以及自举p值)都大于原始值.这反过来是不可能的,因为如果t值上升(这意味着更重要),p值必须更低,对吧?因此我认为我还没有真正理解启动函数的输出(这里:duncan.boot).如何计算引导值?
>我不明白boot()的工作原理.如果你看看duncan.boot< - boot(Duncan,boot.function,1999),你会发现我没有传递函数“boot.function”的任何参数.我想R设置数据< - Duncan.但由于我没有为参数“indices”传递任何内容,我不明白函数“boot.function”中的以下行如何工作数据< - data [indices,]
我希望这些问题有意义!

引导函数“期待”获得一个具有两个参数的函数:第一个是data.frame,第二个是“indices”向量(可能有重复的条目,可能没有使用所有索引)用于选择行然后可能有一些重复或一式三份.)然后用替换的样本由原始数据帧中的重复模式和三次重复确定(多次由“R”用不同的“选择集”确定),将它们传递给中的indices参数. boot.function,然后收集R个函数应用程序的结果.

关于引导对象的print方法报告的内容,请看一下(使用str()检查返回的对象后完成的操作

> duncan.boot$t0
[1] 5.003310e+00 1.053184e-05
> apply(duncan.boot$t, 2, mean)
[1] 5.342895220 0.002607943
> apply(duncan.boot$t, 2, mean) - duncan.boot$t0
[1] 0.339585441 0.002597411

更明显的是,T0值来自原始数据,而偏差是boot() – ed值和T0值之间的差值.我认为,为什么基于参数考虑的p值随着估计的t统计量的增加而增加,这并不是很有意义.当你这样做时,你真的处于两个不同的统计思想区域.我会将p值的增加解释为采样过程的影响,而不考虑正态分布假设.它只是简单地说一下p值的采样分布(这实际上只是另一个样本统计量).

(评论:R开发时使用的资料手册是Davison和Hinkley的“Bootstrap方法及其应用程序”.我没有声称支持我上面的答案,但我想在Hagen Brenner问之后将其作为参考关于在下面的评论中使用两个索引进行采样.在超出简单参数估计之后出现许多意外的自举方面,如果我正在处理更复杂的采样情况,我将首先转向该引用.)

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