TWAS hub:使用TWAS识别疾病易感基因

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TWAS方法用于分析与疾病或者特定性状想关联的基因表达，TWAS hub利用该方法分析了数百个复杂性状，并将分析结果做成了数据库，方便检索和查看，数据库网址如下

​​http://twas-hub.org/​​

该数据库使用了FUSION这款软件进行TWAS分析，相关结果通过以下两种方式查看

1. TRAITS

以性状为单位进行查看， 点击右上角的​​TRAITS​​按钮，会列出所有性状的TWAS结果，示意如下

点击对应的Trait, 可以查看该性状具体的分析结果，以吸烟为例，结果示意如下

列出了所有候选的易感基因。

2. GENES

以性状为单位进行查看， 点击右上角的​​GENES​​按钮，会列出所有基因的结果，示意如下

点击每个基因，可以查看详细信息，以A1BG基因为例，结果示意如下。

首先是该基因相关的models, 即利用不同的reference panel构建的模型

其次是该基因相关联的性状，不同model下计算得到的结果以热图的形式展现

不论是eQTL， eGWAS， 还是TWAS, 其目的都是综合利用基因变异和基因表达的信息，缩小候选基因范围，以更好的定位复杂疾病的易感基因。

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