在Oracle参与过HotSpot VM的研发。这个我有发言权。
Oracle JDK与OpenJDK里的JVM都是HotSpot VM。从源码层面说，两者基本上是同一个东西。
从JDK7开始，Oracle JDK里的HotSpot VM，在研发的时候其实就是用放在http://openjdk.java.net上OpenJDK的Mercurial代码库。也就是说跟大家从外部能实时看到的OpenJDK用的是同一个代码库。
HotSpot VM只有非常非常少量的功能没有在OpenJDK里，那部分在Oracle内部的代码库里。这些私有部分都不涉及JVM的核心功能。
所以当一个Oracle员工要构建OpenJDK时，他要做的事情跟外面的人一样：从http://hg.openjdk.java.net签出代码，构建。
而当他要构建Oracle JDK时，他同样需要先从http://hg.openjdk.java.net签出OpenJDK，然后从Oracle内部的代码库签出私有的部分，放在OpenJDK代码下的一个特定目录里，然后构建。
这些HotSpot VM私有的部分主要是Java Flight Recorder的内部实现，以及还有没有公开到OpenJDK的其它平台的port，例如Oracle自己的ARM、PPC版HotSpot VM。
事实上我以前在Oracle做HotSpot VM的开发时，通常都不签出私有部分的代码，而是直接用OpenJDK的部分来开发。只有到最后要提交代码到JPRT的时候我才会把私有的部分签出来（不然有些私有测试跑不过）。
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JDK6的代码，由于历史原因，Sun JDK6跟OpenJDK6的代码并不同步。但是其中的HotSpot VM仍然是相对一致的。OpenJDK 6里的HotSpot VM只缺了一个Oracle JDK里才有的优化，那就是-XX:+UseCompressedString。这个功能实现得不太好，没带进JDK7/OpenJDK7，所以这点差异没有也罢。
另外，Sun JDK6跟OpenJDK6在切代码的时候不一定是在同一天，所以同一个大版本号（例如HotSpot 20.0）里面的内容可能会稍微有点不一样。例子之一就是Oracle/Sun JDK6u25里有完整的tiered compilation系统的实现，而OpenJDK6对应的HotSpot 20.0却没包含这个实现；同一时间的OpenJDK7分支里的HotSpot VM又有这个功能，说明这个功能本身并不是啥私有功能，只是OpenJDK6切代码的时间有可能比Oracle/Sun JDK6u25早了点。
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下面有评论提醒了我补充一点：Oracle JDK只发布二进制安装包，而OpenJDK只发布源码。
如果使用跟Oracle一样的平台（操作系统/编译器/系统库）来构建OpenJDK，那么得到的二进制的JVM就会跟Oracle JDK里的基本上一样（除了私有部分功能之外）。
总结：
1.Oracle/Sun JDK与OpenJDK的区别和联系
OpenJDK原是SunMicrosystems公司为Java平台构建的Java开发环境（JDK）的开源版本，完全自由，开放源码。Sun Microsystems公司在2006年的JavaOne大会上称将对Java开放源代码，于2009年4月15日正式发布OpenJDK。甲骨文在2010 年收购SunMicrosystem之后接管了这个项目。
Oracle/Sun JDK里面包含的JVM是HotSpotVM，HotSpot VM只有非常非常少量的功能没有在OpenJDK里，那部分在Oracle内部的代码库里。这些私有部分都不涉及JVM的核心功能。所以说，Oracle/Sun JDK与OpenJDK其实使用的是同一个代码库。
从一个Oracle内部员工的角度来看，当他要构建OracleJDK时，他同样需要先从http://hg.openjdk.java.net签出OpenJDK，然后从Oracle内部的代码库签出私有的部分，放在OpenJDK代码下的一个特定目录里，然后构建。
值得注意的是，Oracle JDK只发布二进制安装包，而OpenJDK只发布源码。