和单基因孟德尔遗传疾病的研究相比，复杂疾病的研究虽然取得了一定成效，但还远远谈不上成功，因为影响复杂疾病的因素实在是太多了，比如疾病性状相关的基因座数量很多，等位基因的不完全显性，环境因素的影响等等。其中在复杂疾病的遗传学研究中，有一大热点内容Epistasis,通常称之为上位性。
要理解这个概念，我们从遗传学中的基因互作谈起，由多对基因共同决定某一性状的遗传现象，称之为多因一效multigenic effect, 多因一效的不同基因之间存在相互作用。其中，又可以细分为以下两类
上位性就属于非等位基因互作模型中的一种，非等位基因间的互作有多种模型，详细解释如下
1. 互补作用
complementary effect, 该模型下，两对非等位基因决的性状有两种类型，当两对基因都是显性时是一种性状，当一对为显性，或者两对都为隐性时是另外一种性状，以两个基因座B和G为例，示意如下
两对基因都为显性时是黑色，其他情况下是白色。
2. 积加作用
additive effect, 该模型下，两个基因都为显性时是一种性状，都为隐性时是一种性状，其他情况下又是另外一种性状，示意如下
3. 重叠作用
duplicate effect, 该模型下，多个基因对性状的影响是相同的，这些基因可以看做是重复基因，只需要任意一个基因为显性，对应的性状就能表现出来，示意如下
4. 上位作用
epistatic effect, 指的是决定表型时，一个基因对另外一个基因有遮盖作用，以下图数据为例
可以看到，当G为显性时，无论B是什么基因型，都是black的性状，当G为隐性时，根据B的显性和隐性，出现了white和grey两种性状。对于这样的情况，我们称基因G对基因B有遮盖作用，其中起遮盖作用的是G这个显性Allele，基因G是基因B的上位基因。
又分为以下两种
区别就在于起遮盖作用的显性还是隐性基因，隐性上位的效果如下
可以看到，当G为隐性时，无论B是什么基因型，都是white的性状；当G为显性时，根据B的显性和隐性，出现了grey和black两种性状。
5. 抑制作用
也称之为显性抑制，指的是一个基因本身并不会对性状造成影响，但是它的显性Allele会抑制另外一个基因的作用，示意如下
可以看到，当基因B为显性时，无论基因G是什么基因型，性状都是white,当基因B为隐性时，基因G的作用得以体现，显性G对应性状black, 隐性g对应性状white。
基因间互作的模式有多种，在复杂疾病的研究中，上位性研究的最为火热。上位性是基因相互作用的一种模式，本质是SNP位点间的一种互作。在进行复杂疾病的GWAS研究时，综合考虑基因型，SNP之间的互作，基因型与环境之间的互作等各种因素，有助于更加精确的进行GWAS分析。
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